机巧魔神第二季英文片名:《jiqiaomoshendierji》,发布于2009年,由草川启造,渡部稳宽,矢花馨,中野英明,小林浩辅,信田祐执导,并且由编剧携幕后团队创作。集众多位入野自由,户松遥,野中蓝,田中理惠,森久保祥太郎,佐藤聪美,矢作纱友里,下野纮,丰崎爱生,古山贵实子,石住昭彦,日笠阳子,甲斐田裕子,间岛淳司,喜多村英梨,中井和哉,大原沙耶香,石塚小夜里,高木礼子,藤田圭宣,川田绅司,高梁碧等著名实力派明星加盟。并于2009年在日本上映。
有着复杂家庭环境的男主角夏目智春在三年前空难意外幸存后,开始被自称守护灵的青梅竹马水无神操绪依凭,在高中开学前搬进了其兄长夏目直贵曾居住过的闹鬼房屋鸣樱邸,同日,穿着黑色服装的美女黑崎朱里受其兄长之托将银色手提箱交给了夏目智春,并唤醒了名为“机巧魔神”的谜之兵器。以得到此手提箱为契机,智春得知了世界隐藏的真实--神舍弃了人类,这个世界曾遭一次毁灭,借助“恶魔”之力再生为“第二度世界” 。被下达了必须运用兵器拯救世界的智春,却又遇上了自称恶魔的巫女,还有同样被幽灵缠上的学生会长等人,男主角身边围绕了众多精彩的各型美少女们,轰轰烈烈的故事也该就此开始了……